Neuer Beweis schlägt vor, dass Chikungunya-virus kam in Brasilien mindestens ein Jahr früher, als es erkannt wurde, indem der öffentlichen Gesundheit überwachungssysteme. Wissenschaftler am Zentrum für Infektion und Immunität (CII) an der Columbia Mailman School of Public Health und der Fundação Oswaldo Cruz veröffentlichten Ihre Ergebnisse in der Fachzeitschrift Scientific Reports.
Blut-Proben, die am Institut Nacional de Infectologia in Rio de Janeiro zwischen März 2016 und Juni 2017 wurden analysiert mit Hilfe eines genetischen Tests, den QuantiTect/QuantiNova Beweisen RT-PCR-Kit. Der test identifiziert wurden 40 Proben positiv für das Chikungunya-virus und negativ für das Dengue-virus und das Zika-virus. Forscher dann erneut getestet, diese samples mit dem CII-ArboViroPlex, ein multiplex-test, entwickelt von CII, die gleichzeitig Scannen auf das Vorhandensein von Zika-virus, der alle Serotypen des dengue-virus, chikungunya virus, West-NiL-virus. Die CII-test bestätigte die früheren Prüfung, sondern erfolgt mit höherer Empfindlichkeit, was darauf hindeutet, könnte es der virus identifiziert werden, wenn andere tests nicht konnte.
Vierzehn von diesen Proben repräsentieren Daten über die fünfzehn-Monats-Zeitraum für die Datensammlung wurden weiter analysiert mit VirCapSeq-VERT, eine Methode entwickelt, bei der CII, die für die virale Diagnostik, überwachung und Entdeckung. VirCapSeq-VERT aktiviert die Wiederherstellung der nahezu vollständigen viralen genomischen Sequenzen und Identifizierung der Viren als Vertreter der zentral-Ost-Süd-Afrika-Genotyp des chikungunya-virus.
Eine Analyse der vierzehn genomischen Sequenzen zeigten eine starke Korrelation zwischen der genetischen Divergenz und das Datum, an dem die Probe genommen wurde. Dies ermöglichte es den Forschern zu identifizieren, die von einer „molekularen Uhr“, basierend auf dem Tempo der Mutationen zwischen den Proben. Das timing vorgeschlagen, das virus könnte sich verbreitet haben, so früh wie 2012 und wurde wahrscheinlich importiert aus zentral-Afrika. Chikungunya-virus wurde erstmals berichtet der öffentlichen Gesundheit überwachungssysteme im Jahr 2014.
„Mit den erhöhten Belangen rund um Zika, mehr Brasilianer wurden getestet für die Infektion“, sagt Nischay Mishra, Ph. D., Studienleiterin bei CII. „Zur gleichen Zeit, viele von denen, die geprüft wurden, waren tatsächlich infiziert sich mit dengue-oder chikungunya -, die mit ähnlichen Symptomen.“