Wissenschaftler an der Washington University School of Medicine in St. Louis haben eine $3,7 Millionen Euro Zuschuss von der National Institutes of Health (NIH) zur Unterstützung einer open-source-Datenbank zur Förderung der personifizierte Ansätze zur Behandlung von Krebs. Die Datenbank ist entworfen, um zu helfen ärzte match Krebs-Mutationen — in Patienten‘ Tumoren mit Medikamenten, die Ziel solcher genetischer Fehler.
Die online-Ressource wurde von computational biology Spezialisten Obi L. Griffith, PhD, außerordentlicher professor von Medizin und von Genetik, und Malachi Griffith, PhD, assistant professor der Medizin und von Genetik. Beide sind Forschung Mitglieder der McDonnell-Genom-Institut und der Siteman-Krebs-Mitte am Barnes-Jewish Hospital und Washington University School of Medicine.
Die database’s name CIViC steht für Klinische Interpretationen von Varianten in Krebs. Laut den Gründern ist es das einzige vollständig open-source-online-Ressource zur Abfrage von tumor — Mutationen- wie ein Wikipedia für Krebs-Genomik. Vergleich CIViC Wikipedia — eine online-Enzyklopädie, gepflegt von Freiwilligen — die Griffiths, die sind Zwillingsbrüder, ein system entwickelt, das ermöglicht jedem Benutzer erstellen Sie ein Konto und tragen die Informationen in die Datenbank. Experten auf dem Gebiet dienen, als Redakteure, kuratieren von Daten, die in das system aufgenommen. Es ist auch kostenlos für jedermann zu benutzen.
„Die Aufrechterhaltung up-to-date und umfassende Informationen über die Bedeutung genetischer Mutationen in der Krebs — und was diese Mutationen bedeuten kann für Patienten — ist ein wichtiger Engpass für die Verbesserung der Krebsbehandlung“, sagte Obi Griffith. “CIViC ist die Art von Werkzeug, die helfen können, entlasten, dass Engpass. Mit diesem im Verstand, ist es wichtig, diese Daten offen und für jedermann zugänglich, der Sie braucht. Diese Forschung wird finanziert durch öffentliche Steuergelder, und es sollte zugänglich sein und der Allgemeinheit zur Verfügung.
„Oft, die ärzte haben einige genetische Informationen über einen Patienten tumor, aber es ist nicht klar, was das bedeuten könnte für die Behandlung,“ fügte er hinzu. “Die Suche der wissenschaftlichen Literatur ist zeitaufwendig, und wichtige Daten können sich noch vermisst. Der Zweck der CIViC ist zu straffen und automatisieren Sie diesen Prozess. Es ist eine Ressource, die helfen können ärzte bestimmen, die spezifische Art von Krebs ein patient hat, der Prognose und in einigen Fällen identifizieren, eine Droge, die das Potenzial hat, dem Patienten zu helfen. Dieser neue Zuschuss wird uns helfen, uns weiter zu entwickeln CIViC in eine noch bessere Ressourcen, um diese Art der personalisierten Medizin weiter verbreitet.“
Die genetischen Varianten, die möglicherweise Bedeutung für eine Krebs-Patienten schließen diejenigen ein, dass: Vorhersagen, wie ein patient reagieren könnte, um ein Medikament; unterscheiden zwischen verschiedenen Arten von Krebs, könnte zu sein scheinen die gleichen tumor-Art; angeben, wie aggressiv der Krebs ist wahrscheinlich zu sein; und signal, wie wahrscheinlich eine person zu entwickeln, die eine bestimmte Art von Krebs in der Zukunft.
CIViC ist eine von mehreren ähnlichen Ressourcen versuchen, Informationen über signifikante Krebs genomische Varianten mehr zugänglich für ärzte, die Behandlung von solchen Patienten. Es ist vollständig open access, einschließlich des Quellcodes, der zugrunde liegt, wie es funktioniert, macht CIViC einzigartig. Nach Angaben der Forscher, der CIViC hat mehr als 3.000 Besucher monatlich und 80.000 eindeutige Benutzer, um das Datum, in Erster Linie vom cancer research Institute und Kliniken. Diese Benutzer sind aus 163 Ländern, darunter die USA, China, Japan, Deutschland, Indien, Großbritannien und Südkorea. Einige top-Institutionen, die Bürgerschaftliches zählen die NIH, der Stanford University, der University of California in San Francisco, der Mayo Clinic, Memorial Sloan Kettering Cancer Center, Genentech, M. D. Anderson und Baylor College of Medicine. Viele dieser Nutzer haben Ihre klinische Arbeit Stationen für den automatischen Empfang von Informationen vom CIViC also das tool wird ständig aktualisiert und eingebunden werden können in die ärzte, die den Workflow bei der Behandlung von Patienten.
„Wir empfangen Sie Millionen von hits der CIViC Anwendung von außen-clients, einschließlich der akademischen Institutionen und Unternehmen, die Bürgerschaftliches Daten in Ihre eigenen tools,“ Malachi Griffith sagte. „Wir werden versuchen, zu arbeiten, mit anderen ähnlichen genomischen Daten-Ressourcen, um die Entwicklung von standards für die Interpretation all dieser Informationen, und um sicherzustellen, dass wir so viel Informationen wie möglich, einschließlich neue Entdeckungen, ohne Sie duplizieren zu viele unserer Bemühungen.“
Die Griffiths sind auch aktiv an den internationalen Bemühungen zur Zusammenarbeit mit den Forschern, die dieselbe Arbeit tun und verbinden Ihre Systeme, damit diese Ressourcen zur Verfügung, um alle Krebspatienten, unabhängig davon, wo Sie empfangen Behandlung. Die Forscher half form der Variante der Interpretation für Krebs-Konsortium, eine initiative, die hilft führen die Bemühungen der Global Alliance for Genomics & Gesundheit zu entwickeln, die die Daten-sharing-standards, so dass die ärzte eines Tages machen kann Abfragen an einem Ort, sondern haben Zugriff auf mehrere Krebs-Wikipedia-wie Datenbanken, einschließlich der Bürgerlichen, die alle unterliegen dem gleichen standard-Richtlinien. Das Ziel ist, um sicherzustellen, die ärzte haben Zugriff auf die meisten Informationen, die auf den höchsten Ebenen der Evidenz für die klinische Entscheidungsfindung.