Der Darm-mikrobiota, die aus den Mikroorganismen Leben in unserem Darm, Sie kann uns Informationen über unsere Gesundheit, da Ihre Zusammensetzung hängt von Faktoren wie Ernährung, lebensstil oder unsere Krankheiten. Außerdem, zu wissen, was bestimmte Bakterien in unserem Darm helfen könnte, vorauszusagen, Krankheiten wie Darmkrebs. Neue Fortschritte in der Genom-Sequenzierung Methoden und Bioinformatik-tools, die es uns ermöglichen, die Daten zu analysieren, die uns geholfen haben, zu identifizieren, Tausende von neuen Mikroorganismen, die in unserem Darm durch die Analyse Ihrer genome.
Ein team von Forschern aus der Bellvitge Biomedical Research Institute (IDIBELL) und der katalanischen Institut von Onkologie (ICO) hat im Rahmen einer pilot-test in der Analyse der intestinalen mikrobiota Genom. In dieser Studie wurde analysiert, die mit zwei verschiedenen sequenziermethoden, colon-Biopsien und fäkale Proben von neun Patienten. Das Ziel ist die Implementierung der Sequenzierung Techniken und Bioinformatik-Analyse-tools.
Es ist die erste Untersuchung eines Projekts, das viel umfangreicher. Die Daten, die in dieser pilot-test dienen als Grundlage für das design der Analyse-Methode für die Colonbiome Projekt. Diesem weiteren Projekt-Ziele zu finden mikrobiota Marker, die verwendet werden können für die Früherkennung von Darmkrebs. Um dies zu tun, colon-Biopsien und fäkale Proben gesammelt werden, die von gesunden Patienten und Patienten in verschiedenen Stadien von Darmkrebs. Dann die mikrobiota Genom sequenziert werden, um zu identifizieren, Unterschiede zwischen Gruppen.
Daten, die für alle verfügbar
Alle Daten, die in dieser Pilotstudie wurde eingetragen in die European Nucleotide Archive, eine öffentliche und kollaborative Datenbank, wo alle Arten von genomischen Sequenzen, sind gemeinsam für das wohl der gesamten wissenschaftlichen Gemeinschaft. Darüber hinaus sollen die Ergebnisse dieser ersten pilot-test wurde veröffentlicht in der Wissenschaftlichen Daten, die Zeitschrift, die auch ein öffentliches journal, in dem sowohl die Sequenzen und die Bioinformatik-Analyse verwendeten Methoden sind detailliert.
Diese Studie soll nicht nur nützlich sein für die Zukunft der Arbeit in der Gruppe, aber es soll auch hilfreich sein, für alle Arbeitsgruppen, die mit ähnlichen Analysen oder versuchen, neue Bioinformatik-tools, die den offenen Zugang zu allen Ergebnissen in dieser Studie. Darüber hinaus die Forscher versichern, dass Sie auch öffentlich machen, all die details der nachfolgenden Studien, um weiterhin einen Beitrag für die Zusammenarbeit und Fortschritte im Bereich.
Die zwei sequencing-Methoden